Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23P62829 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23P62829 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23P62829 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23P62829 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23P62829 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23P62829 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23P62829 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23P62829 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23P62829 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23P62829 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23P62829 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23P62829 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23P62829 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23P62829 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL23P62829 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL23P62829 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL23P62829 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms