Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVS71-1P61550 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVS71-1P61550 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms