Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FGF8P55075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FGF8P55075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGF8P55075 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGF8P55075 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGF8P55075 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGF8P55075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGF8P55075 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FGF8P55075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FGF8P55075 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGF8P55075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGF8P55075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGF8P55075 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGF8P55075 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGF8P55075 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGF8P55075 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGF8P55075 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGF8P55075 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms