Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC16A1P53985 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC16A1P53985 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC16A1P53985 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms