Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCAN1P53805 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN1P53805 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN1P53805 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms