Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP11P51784 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP11P51784 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP11P51784 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP11P51784 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP11P51784 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP11P51784 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP11P51784 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP11P51784 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP11P51784 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP11P51784 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP11P51784 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP11P51784 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP11P51784 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP11P51784 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP11P51784 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP11P51784 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP11P51784 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP11P51784 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP11P51784 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP11P51784 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP11P51784 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP11P51784 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP11P51784 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP11P51784 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP11P51784 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP11P51784 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP11P51784 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP11P51784 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP11P51784 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP11P51784 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP11P51784 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP11P51784 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP11P51784 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP11P51784 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP11P51784 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP11P51784 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP11P51784 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP11P51784 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP11P51784 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP11P51784 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP11P51784 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP11P51784 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP11P51784 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP11P51784 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP11P51784 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP11P51784 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP11P51784 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP11P51784 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP11P51784 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP11P51784 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms