Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN1CP49918 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN1CP49918 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms