Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC9A3P48764 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms