Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP2P46087 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP2P46087 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOP2P46087 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOP2P46087 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOP2P46087 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP2P46087 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP2P46087 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP2P46087 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP2P46087 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP2P46087 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP2P46087 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP2P46087 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP2P46087 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP2P46087 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP2P46087 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP2P46087 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP2P46087 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP2P46087 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP2P46087 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP2P46087 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP2P46087 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP2P46087 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP2P46087 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms