Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA3P42263 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA3P42263 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms