Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK1P39086 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms