Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHI3L1P36222 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHI3L1P36222 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms