Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGFR4P22455 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGFR4P22455 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGFR4P22455 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms