Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2CP19387 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2CP19387 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms