Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFEP18615 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NELFEP18615 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFEP18615 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFEP18615 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFEP18615 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFEP18615 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFEP18615 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFEP18615 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFEP18615 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFEP18615 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFEP18615 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFEP18615 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFEP18615 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFEP18615 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFEP18615 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFEP18615 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFEP18615 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFEP18615 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFEP18615 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFEP18615 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFEP18615 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NELFEP18615 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NELFEP18615 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFEP18615 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFEP18615 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NELFEP18615 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NELFEP18615 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NELFEP18615 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFEP18615 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFEP18615 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFEP18615 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFEP18615 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFEP18615 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFEP18615 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFEP18615 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFEP18615 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms