Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-EP13747 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-EP13747 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-EP13747 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms