Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHGAP10645 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CHGAP10645 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CHGAP10645 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHGAP10645 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHGAP10645 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHGAP10645 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHGAP10645 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHGAP10645 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHGAP10645 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHGAP10645 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHGAP10645 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHGAP10645 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHGAP10645 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHGAP10645 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHGAP10645 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHGAP10645 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHGAP10645 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHGAP10645 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHGAP10645 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHGAP10645 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CHGAP10645 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CHGAP10645 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHGAP10645 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHGAP10645 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHGAP10645 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHGAP10645 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHGAP10645 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHGAP10645 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHGAP10645 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHGAP10645 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHGAP10645 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHGAP10645 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHGAP10645 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHGAP10645 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHGAP10645 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHGAP10645 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CHGAP10645 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHGAP10645 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CHGAP10645 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHGAP10645 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHGAP10645 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHGAP10645 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHGAP10645 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHGAP10645 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHGAP10645 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHGAP10645 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHGAP10645 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CHGAP10645 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHGAP10645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHGAP10645 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHGAP10645 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHGAP10645 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHGAP10645 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHGAP10645 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHGAP10645 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHGAP10645 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHGAP10645 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHGAP10645 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHGAP10645 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHGAP10645 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHGAP10645 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHGAP10645 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CHGAP10645 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHGAP10645 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHGAP10645 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHGAP10645 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHGAP10645 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHGAP10645 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHGAP10645 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHGAP10645 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CHGAP10645 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGAP10645 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGAP10645 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHGAP10645 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHGAP10645 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHGAP10645 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHGAP10645 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHGAP10645 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHGAP10645 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHGAP10645 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHGAP10645 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHGAP10645 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHGAP10645 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHGAP10645 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHGAP10645 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHGAP10645 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHGAP10645 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHGAP10645 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHGAP10645 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms