Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA6AP0CW24 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA6AP0CW24 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA6AP0CW24 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms