Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-11P04433 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms