Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOEP02649 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOEP02649 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOEP02649 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOEP02649 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOEP02649 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOEP02649 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOEP02649 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOEP02649 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOEP02649 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APOEP02649 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOEP02649 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOEP02649 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOEP02649 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOEP02649 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APOEP02649 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOEP02649 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOEP02649 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOEP02649 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOEP02649 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOEP02649 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOEP02649 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOEP02649 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOEP02649 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOEP02649 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOEP02649 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOEP02649 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOEP02649 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOEP02649 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOEP02649 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOEP02649 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOEP02649 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOEP02649 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOEP02649 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOEP02649 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOEP02649 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOEP02649 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOEP02649 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOEP02649 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOEP02649 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOEP02649 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOEP02649 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOEP02649 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOEP02649 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOEP02649 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOEP02649 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOEP02649 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOEP02649 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOEP02649 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOEP02649 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms