Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPP01282 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VIPP01282 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VIPP01282 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPP01282 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPP01282 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VIPP01282 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIPP01282 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPP01282 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPP01282 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPP01282 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPP01282 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPP01282 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIPP01282 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIPP01282 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VIPP01282 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VIPP01282 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPP01282 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPP01282 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPP01282 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPP01282 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPP01282 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPP01282 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPP01282 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPP01282 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIPP01282 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPP01282 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPP01282 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPP01282 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPP01282 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPP01282 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPP01282 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms