Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSO75390 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSO75390 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSO75390 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSO75390 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSO75390 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSO75390 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSO75390 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSO75390 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSO75390 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSO75390 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSO75390 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSO75390 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSO75390 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSO75390 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSO75390 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSO75390 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSO75390 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSO75390 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSO75390 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSO75390 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSO75390 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSO75390 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSO75390 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSO75390 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSO75390 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSO75390 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSO75390 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSO75390 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSO75390 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSO75390 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms