Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA3O75145 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA3O75145 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA3O75145 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA3O75145 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA3O75145 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA3O75145 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA3O75145 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA3O75145 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA3O75145 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA3O75145 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA3O75145 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA3O75145 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA3O75145 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA3O75145 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA3O75145 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA3O75145 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA3O75145 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA3O75145 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA3O75145 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA3O75145 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA3O75145 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA3O75145 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA3O75145 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA3O75145 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA3O75145 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA3O75145 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA3O75145 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIA3O75145 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA3O75145 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms