Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRNO43815 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRNO43815 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRNO43815 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRNO43815 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRNO43815 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRNO43815 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRNO43815 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRNO43815 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRNO43815 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRNO43815 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRNO43815 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRNO43815 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRNO43815 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRNO43815 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRNO43815 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRNO43815 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRNO43815 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRNO43815 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRNO43815 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRNO43815 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
STRNO43815 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRNO43815 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRNO43815 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRNO43815 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRNO43815 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
STRNO43815 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRNO43815 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRNO43815 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRNO43815 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRNO43815 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRNO43815 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRNO43815 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRNO43815 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRNO43815 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRNO43815 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRNO43815 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
STRNO43815 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRNO43815 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRNO43815 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRNO43815 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRNO43815 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRNO43815 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRNO43815 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRNO43815 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRNO43815 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRNO43815 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
STRNO43815 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRNO43815 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
STRNO43815 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRNO43815 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRNO43815 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRNO43815 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRNO43815 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRNO43815 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRNO43815 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRNO43815 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRNO43815 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRNO43815 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRNO43815 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRNO43815 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRNO43815 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRNO43815 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRNO43815 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRNO43815 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRNO43815 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRNO43815 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRNO43815 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRNO43815 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRNO43815 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRNO43815 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRNO43815 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms