Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIPA1L1O43166 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SIPA1L1O43166 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIPA1L1O43166 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L1O43166 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms