Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H7C0S8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
H7C0S8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H7C0S8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H7C0S8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0S8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0S8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0S8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0S8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H7C0S8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0S8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0S8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0S8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0S8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0S8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H7C0S8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H7C0S8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0S8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H7C0S8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H7C0S8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H7C0S8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H7C0S8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H7C0S8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H7C0S8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0S8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0S8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H7C0S8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0S8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0S8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H7C0S8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms