Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms