Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KRTAP4-16G5E9R7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP4-16G5E9R7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KRTAP4-16G5E9R7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP4-16G5E9R7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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