Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVV-2B6SEH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ERVV-2B6SEH9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVV-2B6SEH9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVV-2B6SEH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms