Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DGG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DGG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DGG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DGG1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DGG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DGG1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DGG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DGG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DGG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DGG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4DGG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DGG1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DGG1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DGG1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DGG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DGG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DGG1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DGG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DGG1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DGG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DGG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DGG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DGG1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DGG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DGG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DGG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DGG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DGG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DGG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms