Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A6NIN4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A6NIN4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A6NIN4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
A6NIN4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
A6NIN4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
A6NIN4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A6NIN4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A6NIN4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A6NIN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A6NIN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A6NIN4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A6NIN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
A6NIN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
A6NIN4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A6NIN4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A6NIN4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A6NIN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A6NIN4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A6NIN4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A6NIN4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A6NIN4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms