Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC182A6NF36 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC182A6NF36 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC182A6NF36 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms