Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP46A1Q9Y6A2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP46A1Q9Y6A2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CYP46A1Q9Y6A2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP46A1Q9Y6A2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms