Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG1Q9Y678 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG1Q9Y678 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms