Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GTF3C5Q9Y5Q8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C5Q9Y5Q8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms