Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD3Q9Y597 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD3Q9Y597 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms