Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1277.6 ms