Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P9

RABGAP1, Rab GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1Q9Y3P9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGAP1Q9Y3P9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGAP1Q9Y3P9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGAP1Q9Y3P9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms