Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF6Q9Y252 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF6Q9Y252 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms