Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA8BQ9ULN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms