Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
INO80Q9ULG1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
INO80Q9ULG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
INO80Q9ULG1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
INO80Q9ULG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms