Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB23Q9ULC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB23Q9ULC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB23Q9ULC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB23Q9ULC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms