Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5BQ9UGL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5BQ9UGL1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5BQ9UGL1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5BQ9UGL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KDM5BQ9UGL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms