Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPG2Q9UBF2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPG2Q9UBF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms