Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC88CQ9P219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC88CQ9P219 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms