Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMT1Q9NXH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMT1Q9NXH9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMT1Q9NXH9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms