Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COMMD8Q9NX08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD8Q9NX08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD8Q9NX08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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