Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREX1Q9NSU2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TREX1Q9NSU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TREX1Q9NSU2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms