Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM9Q9NQV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM9Q9NQV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM9Q9NQV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms