Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPS4Q9NQG7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS4Q9NQG7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPS4Q9NQG7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPS4Q9NQG7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms